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WinRHIZO根系分析系統(tǒng)利用高質(zhì)量圖形掃描儀獲取高分辨率植物根系彩色圖像或黑白圖像，該掃描儀在掃描面板下方和上蓋中安裝有專門的雙光源照明系統(tǒng)，并且在掃面板上預(yù)留了雙光源校準(zhǔn)區(qū)域。此外，還配備有不同尺寸的專用、高透明度根系放置盤。掃描時(shí)，掃面板下的光源和上蓋板中的光源同時(shí)掃過高透明度根盤中的根系樣品，這樣可以避免根系掃描時(shí)容易產(chǎn)生的陰影和不均勻等現(xiàn)象的影響，有效地保證了獲取的圖像質(zhì)量.采用非統(tǒng)計(jì)學(xué)方法測量計(jì)算出交叉重疊部分根系長度、直徑、面積、體積、根尖等基本的形態(tài)學(xué)參數(shù)；利用軟件的色彩等***分析功能，還可以對根系顏色進(jìn)行分析，從而進(jìn)行根系存活數(shù)量、根系生長和營養(yǎng)狀況等方面研究；利用軟件的高***分析功能，還可以對完整的植物根系圖像進(jìn)行根系連接分析（研究根系分支角度、連通性等形態(tài)特征）、根系拓?fù)浞治觯ㄑ芯扛颠B接數(shù)量、路徑長度）和根系分***伸展分析（記錄根系整體等***分布情況）。從而滿足研究者針對植物根系不同類別和層次的研究.