Life Technologies于2010年底推出了首款半導(dǎo)體測序儀:Ion Personal Genome Machine(PGM?)測序儀。
Ion Torrent, 個(gè)人化操作基因組測序儀(PGM?), 是市場上相較其他測序技術(shù),更簡單,經(jīng)濟(jì)和具有強(qiáng)大的可擴(kuò)展性的測序平臺。PGM?臺式系統(tǒng)的設(shè)計(jì)配合革新性的半導(dǎo)體芯片技術(shù),使整個(gè)平臺具有極高的擴(kuò)展性和快速完成測序的性能。
Ion Torrent 技術(shù)通過專有的大規(guī)模并行半導(dǎo)體感應(yīng)器,對于DNA 擴(kuò)增時(shí)產(chǎn)生的離子流,實(shí)現(xiàn)直接和實(shí)時(shí)的檢測。當(dāng)試劑通過集成的流體通路進(jìn)入Ion Torrent半導(dǎo)體芯片中,密布于芯片上的反應(yīng)孔立即成為上百萬個(gè)微反應(yīng)體系。這種獨(dú)特的流體體系,微體系機(jī)械設(shè)計(jì)和半導(dǎo)體的技術(shù)組合,使我們得以快速直接的將遺傳信息翻譯成數(shù)碼的DNA測序結(jié)果,得到大量高質(zhì)量的測序數(shù)據(jù)。
個(gè)人化操作基因組測序儀,配合Ion Torrent的半導(dǎo)體芯片,反應(yīng)試劑盒和計(jì)算機(jī)服務(wù)器,數(shù)據(jù)分析套件,提供您最尖端的測序解決方案。
它具有以下三個(gè)突出優(yōu)點(diǎn):
強(qiáng)大的擴(kuò)展性:大規(guī)??蓴U(kuò)展的半導(dǎo)體芯片技術(shù)
簡捷易用的技術(shù):自然的生物化學(xué)原理,無需光學(xué)部件
無以倫比的快速:2個(gè)小時(shí)完成測序工作
發(fā)現(xiàn)‘?dāng)U展’
比擬半導(dǎo)體技術(shù)升級的強(qiáng)大擴(kuò)展性
? 技術(shù)的基礎(chǔ)以超過千億美金規(guī)模的半導(dǎo)體產(chǎn)業(yè)為支持
? 芯片密度的提升以40年來累積驗(yàn)證的摩爾定律為證據(jù)
? 芯片產(chǎn)量的擴(kuò)展以四百家標(biāo)準(zhǔn)化半導(dǎo)體生產(chǎn)企業(yè)為選擇
發(fā)現(xiàn)‘簡捷’
簡單真實(shí)的生物化學(xué)原理
? 真實(shí)的離子流測序原理
? 無修飾的核酸,無需酶化學(xué)級聯(lián),無需任何熒光和化學(xué)發(fā)光
? 經(jīng)濟(jì)的標(biāo)準(zhǔn)試劑
發(fā)現(xiàn)‘快速’
直接,實(shí)時(shí)的測序技術(shù)
? 實(shí)現(xiàn)更多的研究和市場應(yīng)用
? 快速的運(yùn)行時(shí)間提速研究周期和文章的發(fā)表
? 革新性的半導(dǎo)體測序芯片,無需光學(xué)檢測和掃描
測序和分析流程
Ion Torrent 測序流程標(biāo)準(zhǔn)的要素包括,從準(zhǔn)備隨機(jī)片段的DNA 文庫或者擴(kuò)增子文庫,到樣本的PCR 擴(kuò)增和在PGM?的測序運(yùn)行。
完成整個(gè)PGM?的測序運(yùn)行后,數(shù)據(jù)將會自動(dòng)的導(dǎo)入專用的Torrent 預(yù)裝分析套件的計(jì)算機(jī)服務(wù)器。在這里,原始的測序信號會轉(zhuǎn)化成堿基序列并且以工業(yè)標(biāo)準(zhǔn)的SFF或者FASTAQ格式存儲起來。這些測序數(shù)據(jù)可以通過眾多商業(yè)化的軟件進(jìn)行后續(xù)不同應(yīng)用的分析或者全新基因組的拼接。
Ion 314 測序芯片
芯片規(guī)模:130萬個(gè)反應(yīng)微孔
數(shù)據(jù)輸出:以超過1千萬高質(zhì)量測序數(shù)據(jù)為起始
測序長度:以100個(gè)堿基為起始
數(shù)據(jù)格式:SFF/FASTQ 數(shù)據(jù)格式
試劑:314 芯片試劑套裝,包括文庫,樣本和測序試劑
應(yīng)用:微生物基因組測序和重測序,靶標(biāo)(擴(kuò)增子)區(qū)域重測序