快速菌膜鑒定,真的可以嘗試嗎?
為了縮短鑒定時間,快速提供臨床可信賴的結(jié)果,在以“為所有膿毒癥患者提供48小時內(nèi)***低抑菌濃度藥敏結(jié)果”為目標(biāo)的膿毒癥全流程解決方案中,MALDI-TOF MS是實現(xiàn)快速鑒定分***報告的重要環(huán)節(jié)。針對陽性血培養(yǎng)進行快速質(zhì)譜鑒定能夠進***步免去隔夜傳代培養(yǎng)時間,從而加速報告。因此,陽性血培養(yǎng)的快速鑒定方法成為大多數(shù)實驗室關(guān)注的焦點。 2019年,歐洲臨床微生物學(xué)和傳染病學(xué)會(ESCMID)發(fā)起了***項基于微生物實驗室血培養(yǎng)流程的現(xiàn)狀調(diào)研,其中37.3%(78/209)的實驗室進行了血培養(yǎng)菌膜的快速鑒定。 本文分享了三篇應(yīng)用VITEK MS的研究,研究從固體培養(yǎng)基上挑選短時孵育(從常規(guī)的16-24小時孵育縮短到4-8小時)的菌膜進行直接鑒定。相較于直接從陽性血培養(yǎng)物中提取鑒定細(xì)菌,這種方法操作更加方便,并且減少了肉湯培養(yǎng)基和血液對鑒定結(jié)果的干擾因素。
文獻*** VITEK MS短時孵育3h、5h的鑒定成功率[1] 意大利都靈大學(xué)醫(yī)學(xué)院共入組了162例單微生物血液培養(yǎng)物,其中121例為革蘭氏陰性菌株(占74.7%),32例為革蘭氏陽性菌株(占19.8%),以及9例酵母菌株(占5.6%)。研究發(fā)現(xiàn),質(zhì)譜在種水平鑒定上的準(zhǔn)確性與傳統(tǒng)方法相比,在3小時、5小時和24小時的時間點分別達到60.5%、80.2%和93.8%的***致性。 對于革蘭氏陰性菌,腸桿菌科的鑒定率***高;對于革蘭氏陽性球菌,金黃色葡萄球菌的鑒定結(jié)果***好(鑒定成功率為***)。此外,研究發(fā)現(xiàn),凝固酶陰性葡萄球菌(CoNS)在培養(yǎng)5小時后就獲得了良好的鑒定結(jié)果(鑒定成功率為88.2%),且沒有被誤認(rèn)為金黃色葡萄球菌,這無疑是快速區(qū)分真正的病原體及可能的污染的有效方法。 然而,在***篇關(guān)于某***際進口品牌B評估的文章中,研究對435個單微生物培養(yǎng)物進行了快速鑒定。結(jié)果顯示,在傳代短時孵育5小時后,金黃色葡萄球菌的鑒定成功率為79.5%,而凝固酶陰性葡萄球菌(CoNS)的鑒定成功率為53.8%[2]。 VITEK MS從建庫菌株的多樣性出發(fā),同時考慮操作人員和培養(yǎng)條件的差異,采用權(quán)重矩陣算法構(gòu)建準(zhǔn)確數(shù)據(jù)庫。這是目前唯***能夠提供單***臨床診斷結(jié)果的平臺,無需在多個鑒定結(jié)果中進行選擇,從而將報告結(jié)果錯誤的風(fēng)險降至***低。該平臺可以為臨床提供準(zhǔn)確且快速的二***鑒定報告。 文獻二 VITEK MS短時孵育6h、8h的鑒定成功率[3] 芝加哥大學(xué)醫(yī)學(xué)院共收集了134例血培養(yǎng)陽性樣本,這些樣本被直接轉(zhuǎn)種至預(yù)熱1小時的血平板,并在培養(yǎng)2、4、6、8、10小時后進行評估,無需進行乙醇-甲酸蛋白質(zhì)提取。研究發(fā)現(xiàn),在培養(yǎng)4小時后,陰性菌的正確鑒定率達到94%;在培養(yǎng)6小時后,陽性菌的正確鑒定率達到98%。 總體上,培養(yǎng)6小時后的總鑒定成功率超過90%;培養(yǎng)8小時后,總鑒定成功率達到95%。 文獻三 VITEK MS PRIME 短時孵育3-4h菌膜鑒定成功率[4] VITEK MS PRIME是2024年新上市的質(zhì)譜系列產(chǎn)品,完全延續(xù)了VITEK? MS在數(shù)據(jù)庫和算法上的可靠性,同時改善了操作流程的體驗感。實驗室可隨時加載靶板并調(diào)整檢測優(yōu)先***,***多支持16張靶板同時在線,可在實驗室任意電腦上進行信息錄入及結(jié)果查看,將人在設(shè)備面前的等待時間降至零,優(yōu)化了鑒定流程。該系統(tǒng)更高效地實現(xiàn)了與LIS分***報告及VITEK 2藥敏流程的對接,從而節(jié)省人力、提升TAT(周轉(zhuǎn)時間),并支持臨床更早從經(jīng)驗治療轉(zhuǎn)向目標(biāo)治療。 ***項納入218株菌的臨床實驗數(shù)據(jù)顯示,VITEK MS PRIME在3-4小時培養(yǎng)(菌膜)后的鑒定成功率高達70.2%,而某***際進口品牌B的成功率為55.5%。 準(zhǔn)確且快速的二***鑒定報告的發(fā)出,必須基于***個穩(wěn)定且可靠的數(shù)據(jù)庫,并配合信息化的全流程溯源,才能真正助力微生物實驗室在血流感染患者中的抗菌藥物治療。需要注意的是,在使用菌膜進行二***報告鑒定前需進行性能驗證,對于無法通過此方法識別的微生物(例如,血培養(yǎng)混合感染樣本、革蘭氏陽性桿菌、厭氧菌及酵母菌等),仍需通過過夜培養(yǎng)以獲得成熟菌落進行識別。 目前,***內(nèi)已有多***實驗室實現(xiàn)了鑒定時間少于32小時的二***報告。中***科學(xué)技術(shù)大學(xué)附屬醫(yī)院評估并比較了使用VITEK MS進行的快速微生物鑒定與常規(guī)微生物鑒定對血流感染住院患者抗生素使用、臨床結(jié)局和衛(wèi)生經(jīng)濟學(xué)的影響。研究顯示,引入VITEK MS后,從入院到***次目標(biāo)性抗生素治療的時間縮短了28.7小時(p<0.001),平均住院時間縮短了5.9天(p<0.001),平均節(jié)省抗生素費用7300元(1021美元)(p<0.001),平均住院費用節(jié)省24078元(3368美元)(p<0.001)。該研究內(nèi)容也發(fā)表在2024年ECCMID(Poster NO:P0874)。 參考文獻: [1] Curtoni A, Cipriani R, Marra ES, Barbui AM, Cavallo R, Costa C. Rapid Identification of Microorganisms from Positive Blood Culture by MALDI-TOF MS After Short-Term Incubation on Solid Medium. Curr Microbiol. 2017;74(1):97-102. [2] Pranada AB, Cordovana M, Meyer M, et al. Identification of micro-organism from positive blood cultures: comparison of three different short culturing methods to the Rapid Sepsityper workflow. J Med Microbiol. 2022;71(8):10.1099 [3] Bhatti MM, Boonlayangoor S, Beavis KG, Tesic V. Rapid identification of positive blood cultures by matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry using prewarmed agar plates. J Clin Microbiol. 2014;52(12):4334-4338. [4] Grohs P, Remaud E, Lath C, et al. Comparison of the New VITEK MS PRIME System with the Matrix-Assisted Laser Desorption Ionization Biotyper Microflex LT for the Identification of Microorganisms. Ann Lab Med. 2023;43(6):574-584.
(文章來源于儀器網(wǎng))