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Oxford Nanopore Technologies的Hagan Bayley及他的研究小組正致力于改善納米孔。根據(jù)他們之前的工作，他們以a-溶血素來設(shè)計納米孔，并將環(huán)式糊精共價結(jié)合在孔的內(nèi)側(cè)（下圖）。當(dāng)核酸外切酶消化單鏈DNA后，單個堿基落入孔中，它們瞬間與環(huán)式糊精相互作用，并阻礙了穿過孔中的電流。每個堿基ATGC以及甲基胞嘧啶都有自己特有的電流振幅，因此很容易轉(zhuǎn)化成DNA序列。每個堿基也有特有的平均停留時間，它的解離速率常數(shù)是電壓依賴的，+180 mV的電位能確保堿基從孔的另***側(cè)離開。

a-溶血素納米孔（剖面圖）以及共價結(jié)合的環(huán)式糊精（淺藍(lán)色）瞬間結(jié)合落入孔中的堿基（紅色）。

以往對甲基胞嘧啶進(jìn)行測序，都要先進(jìn)行重亞硫酸鹽轉(zhuǎn)化，而納米孔技術(shù)能直接讀出這第五種堿基。這對表觀基因組測序的研究人員來說可謂是個好消息。

納米孔測序預(yù)計能滿足大部分測序用戶的需求：99.8%的準(zhǔn)確性相當(dāng)高，且錯誤很容易通過計算來糾正。均聚物延伸也沒有問題，因為納米孔記錄每***個堿基，而不管其前后的堿基。讀長也會很長。Bayley認(rèn)為：“它有可能讀取數(shù)千個堿基，序列質(zhì)量也不會下降。即使中途有***些小差錯，它也可以重新開始。”

但是，Oxford Nanopore的測序儀仍面臨兩個重要的技術(shù)問題。***是如何將核酸外切酶更好地附著在孔上，讓它每次只掉入***個堿基，這是***個大挑戰(zhàn)。另***個是并行化。這個問題可能簡單***些。他們可以開發(fā)出***個芯片，上面有數(shù)萬個孔，來確保整個測序過程更快速。

在納米孔測序技術(shù)的推動下，實現(xiàn)千元基因組的目標(biāo)指日可待了。