技術(shù)特點(diǎn)
* 超高通量:同時(shí)對(duì)上億條序列進(jìn)行測(cè)序,每次實(shí)驗(yàn)?zāi)墚a(chǎn)生數(shù)十億的堿基信息。
* 高靈敏度:能夠檢測(cè)到豐度極低的序列以及測(cè)序微量的珍貴樣品。
* 高精確率:自動(dòng)化的測(cè)序流程和數(shù)據(jù)處理保證了測(cè)序數(shù)據(jù)的精確性。
* 廣泛的應(yīng)用領(lǐng)域:能夠靈活地應(yīng)用于基因組學(xué),轉(zhuǎn)錄組學(xué)以及表觀遺傳組學(xué)研究
技術(shù)原理
基于Genome Analyzer IIx系統(tǒng)的高通量測(cè)序技術(shù)首先是將樣品DNA打斷成合適的大?。s100~200bp),兩端連接上特定的DNA接頭,使用PCR擴(kuò)增后制成測(cè)序文庫(kù)。隨后使其利用堿基互補(bǔ)原理隨機(jī)結(jié)合到含有接頭的flow cell上,利用橋式PCR(Bridge PCR)反應(yīng)獲得上億條成簇分布的待測(cè)序列。最后使用Illumina特有的邊合成邊測(cè)序技術(shù)(Sequencing By Synthesis),在DNA聚合酶和熒光標(biāo)記的dNTP作用下,隨著每一輪測(cè)序引物延伸,相應(yīng)結(jié)合到延伸鏈的熒光標(biāo)記dNTP被激發(fā)釋放出熒光信號(hào),測(cè)序儀通過(guò)捕獲相應(yīng)位置的熒光信號(hào),并轉(zhuǎn)換獲得該位置待測(cè)片段的序列信息。整個(gè)測(cè)序過(guò)程完全由計(jì)算機(jī)自動(dòng)化處理完成,能夠在極短時(shí)間內(nèi)獲得數(shù)十億高精確度的堿基序列信息,是目前實(shí)用性最強(qiáng)的新一代測(cè)序技術(shù)。
康成生物提供基于Illumina Genome Analyzer IIx測(cè)序系統(tǒng)的高通量測(cè)序服務(wù)項(xiàng)目,為基因組,轉(zhuǎn)錄組以及表觀遺傳組等研究領(lǐng)域的廣大研究人員提供更深入,更全面的技術(shù)服務(wù):
microRNA測(cè)序服務(wù)
能夠直接對(duì)樣本中指定大小的所有microRNA分子進(jìn)行高通量測(cè)序,在無(wú)需任何序列信息的前提下研究microRNA的表達(dá)并在此基礎(chǔ)上發(fā)現(xiàn)和鑒定新的microRNA分子,并提供了更加靈活和深入的分析和研究方法。
染色質(zhì)免疫共沉淀測(cè)序服務(wù)
ChIP-Sequencing技術(shù)能夠在全基因組水平更精確,更靈敏的檢測(cè)組蛋白各種共價(jià)修飾、CTCF、RNA聚合酶II以及各種轉(zhuǎn)錄因子等DNA結(jié)合蛋白在基因組上的精確結(jié)合位點(diǎn),為表觀遺傳組學(xué)與基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控機(jī)制提供了更加有力的分析手段。
DNA甲基化測(cè)序服務(wù)
基于Illumina高通量測(cè)序平臺(tái)的DNA甲基化測(cè)序能夠獲得全基因組范圍內(nèi)高精度的甲基化狀態(tài),不受物種和基因組區(qū)域的限制,是全面且深入理解表觀遺傳調(diào)控最好的研究手段。
基因表達(dá)標(biāo)簽測(cè)序服務(wù)
能夠提供更加精確的數(shù)字化信號(hào),更高的基因表達(dá)數(shù)據(jù)檢測(cè)通量以及更廣的檢測(cè)范圍,在檢測(cè)未知轉(zhuǎn)錄本,稀有轉(zhuǎn)錄本以及反義轉(zhuǎn)錄本等方面具有無(wú)可比擬的優(yōu)勢(shì)。
轉(zhuǎn)錄組測(cè)序服務(wù)
能夠在單核苷酸水平對(duì)任意物種的整體轉(zhuǎn)錄活動(dòng)進(jìn)行檢測(cè),在分析轉(zhuǎn)錄本的結(jié)構(gòu)和表達(dá)水平的同時(shí),還能夠發(fā)現(xiàn)未知轉(zhuǎn)錄本和稀有轉(zhuǎn)錄本,精確地識(shí)別可變剪切位點(diǎn)以及cSNP(編碼序列單核苷酸多態(tài)性),提供最全面的轉(zhuǎn)錄組信息。